Бухгалтерия университета выполняет следующие функции:

• бухгалтерский учет - процесс создания системы бухгалтерского учета вуза для обеспечения пользователей полной и достоверной информацией о финансово-хозяйственной деятельности и финансовом состоянии вуза;
• предоставляет своевременную информацию об оценке, анализе, оформлении и мониторинге финансовых и операционных отчетов и результатов университета;
• подготавливает и утверждает формы внутреннего учета, формы первичных учетных документов, используемых для оформления хозяйственных операций, план бухгалтерского учета, состоящий из статистической и аналитической отчетности;
• обеспечивает процедуры инвентаризации и оценки имущества, документацию о наличии, состоянии и оценке имущества;
• устанавливает систему внутреннего контроля за правильностью оформления хозяйственных и бухгалтерских операций при оформлении документа;
• формирует систему учетно-отчетной информации, отвечающую требованиям бухгалтерского, налогового, статистического и управленческого учета, предоставляя необходимую информацию внешним пользователям;
• осуществляет работу по учету финансовой деятельности университета, финансовых, учетных и кредитных операций, финансовых ресурсов, материальных и производственных резервов, основных средств, обязательств и имущества; 

Бухгалтерский учет обеспечивает:

• точное и своевременное подтверждение хозяйственных операций, движения денежных средств, формирования доходов и расходов и исполнения обязательств по расчетному счету бухгалтерии университета;
• своевременное взимание налогов и сборов в республиканский, областной и местный бюджеты, страховых взносов во внебюджетные социальные фонды, платежных кредитных организаций, средств финансирования, задолженности по долгам;
• контроль использования организацией платежной ведомости и точности расчетов заработной платы, инвентаризации, процедур бухгалтерского учета и отчетности, а также юридических проверок;
• участие в формировании налоговой политики при финансовом анализе информации в бухгалтерском учете и отчетности организации аудита;
• разработка предложений, направленных на улучшение финансовых показателей университета, изучение финансовых и нефинансовых затрат;
• обеспечение соблюдения финансовых и бухгалтерских правил, а также законности отчетности о недостатках, дебиторской задолженности и различных убытках.